Stanislav Subbota

Проблема похоже в плагине "Remove slug from custom post type". Попробуйте после опубликования нового кастомного поста перезапустить этот плагин. Похоже он новые посты не учитывает.

Но возможно проблема и/только в пермалинках. После установки этого плагина нужно было поставить на стандарт и потом опять на то, что использовали.

Первый вариант - запретить индексацию данной категории (например при помощи SEO-плагина).
Второй вариант - 301 redirect. Много вариантов реализации - плагин, .htaccess, functions.php

Советую использовать multisite - codex.wordpress.org/Create_A_Network Считаю это решение более надежным, чем использование плагинов. Если плагин, wpml. qTranslate не советую, тк он сохраняет переводы в метатеги. При удалении этого плагина в будущем (об этом тоже надо думать) могут возникнуть непредвиденные проблемы .