В JIRA существует handler-ы, которые позволяют либо создавать, либо комментировать тикеты. Они так и называются:
Create Issue Handler
Full Comment Handler
и др. (cvs comment. regex, non quoted)
Настраиваются они через Сервисы (Services).
По крайней мере так в версии 3.13. Сам пользовался только создание тикетов через почту.