Что до предлагаемого набора функций, то для 2010 года это хорошая попытка, за исключением, пожалуй, адовой обработки ошибок и отсутствия подстановок в хелперах. Я очень надеюсь, что автор с тех пор вырос, и написал вместо этого зоопарка нормальный класс.
Аффтар второй статьи - клинический идиот. Ну, или, скорее, маленький мальчик, который предпочитает игрушечную машинку настоящей, потому что игрушечную можно возить в песочнице, а настоящую нельзя. Такого фантастического бреда я давно не читал. До холивара этой писульке как до луны. Холивар - это когда две стоящих вещи сравнивают. А здесь претензии вида "в mysqli надо передавать идентификатор".
Если бы там был SQL - лично у меня бы вопросов не было. но когда он собирается частично квери билдером, частично параметрами функций, и частично SQL - это та самая содомия.