import settings #подразумевается что файл уже создан иначе ошибка
#обращение к внешним переменным
print(settings.window_theme)
#перезапись всего файла
with open("settings.py", "w", encoding="utf8") as file:
#осуществляешь перезапись
#перезапись переменной, если она не константная
settings.window_them = "WhiteBlue20"
window_theme = 'DarkBlue10'
checkbox1 = True
checkbox2 = False
https://docs.python.org/3/library/asyncio.html