Я сталкивался с такой проблемой. Телеграм боты не работают из РФ, та самая блокировка.
Используй VPN. Я использовал ProtonVPN и всё прекрасно работало.
Об этом говорит первая часть ошибки (Caused by ConnectTimeoutError(, 'Connection to api.telegram.org timed out. (connect timeout=3.5)'))"),).