Андрей Михалёв

1) сделать JS на странице с удалением кэша и куки.
2) временно поставить заглушку на главную страницу, в заглушке рассказать как почистить куки. предусмотреть переход на сайт, если пользователь уже все почистил.
3) сделать e-mail рассылку по всем пользователям сайта.

видимо сбой при удалении, либо пакет корявый.

открываем файл /var/lib/dpkg/status
удаляем строки касающиеся gitter

Редиректы делает только веб-сервер. DNS для таких задач не предназначен!

у Debian есть инструкция как обновляться. Все расписано по шагам.
Из года в год ничего существенного не меняется.

Apache обрабатывает только php. А все ошибки обычно отправляет frontend. Поэтому достаточно настроить только nginx

У вас не закрыт доступ к /xmlrpc.php . Злоумышленники очень часто пользуются им чтобы попытаться взломать сайт, тем самым создают нагрузку.
Закройте доступ к нему через админку или настройте .htaccess
Или просто переименуйте/переместите файл.

нужно либо создать фоновый процесс, либо использовать screen.

Каким мануалом по замене диска в массиве пользовались?
На сколько я помню, порядок такой:
1. помечаем раздел sdb1 в массиве md0 как сбойный:
mdadm --manage /dev/md0 --fail /dev/sdb1
2. Удаляем раздел sdb1 из массива md0:
mdadm --manage /dev/md0 --remove /dev/sdb1
3. скопировать разметку с диска sda на новый диск sdb. (Выполнять нужно с чистой головой, чтобы не затереть вообще все данные!!!)
sfdisk -d /dev/sda | sfdisk --force /dev/sdb
4. Добавляем новый раздел в массив md0
mdadm --manage /dev/md0 --add /dev/sdb1

1) сервер по умолчанию default_server, соответственно как минимум:

listen 80 default_server;
server_name _;

2) то что у вас есть файл в sites-enabled | sites-available не говорит что он обработается. как уже говорили, нужно смотреть какие файлы ищет include в конфиге nginx.conf!
3) я надеюсь вы тестируете конфиги после изменения?
nginx -t
и применяете новые конфиги?
nginx -s reload

1) авторизация и telnet? вы шутите? telnet вообще нельзя держать на сервере попой к интернету! есть же ssh, зачем вам эти извращения?
2) а кто вам сказал что письма отправляются без авторизации на вашем сервере?
если я напишу вам письмо, и укажу имя и адрес вашего соседа, это не значит что сосед у вас дурачок, и пишет вам письма. Тоже самое и в электронной почте.
читайте про DKIM, DMARC и SPF. и все ваши проблему сразу уйдут.

X-mailer: Pegasus Mail for Windows (4.61)

А еще я бы блокировал почтовые сервера у которых нет корректного обратного адреса (PTR), иначе вас любые программы для почтовых рассылок засыпят спамом!