1. Прототип создается для того, что бы дизайнер знал, в каком месте располагался тот или иной элемент. При создании прототипа нужно не только напихать элементы управления, но и подумать насколько это будет удобно с точки зрения пользователя (usability). Почитайте про Usability.
2. Придерживайтесь одного шрифта во всем приложении.
3. Подберите иконки подходящие общему стилю приложения. Добейте гармоничности.
4. Полно видео на эту тему вот пример первый попавшийся
https://www.youtube.com/watch?v=YhE9k_0vrwY.
Лучше для каждой страницы отдельный PSD файл.