хм....все зависит от ситуации.
то что легко подгоняется
padding - ами и margin - ами
подгоняете ими, а остальное с помощью position
К примеру, вот это версталось с помощью pixel perfect.
p.s. 1 - это с помощью padding и margin, 2 - при помощи position

Старайтесь использовать position как можно реже. Только в самых необходимых случаях (я про absolute, fixed)