DrNemo

Я обычно использую объект-интерфейс для таких задач.
типа:

$result = new Item;
...
$result->setError('error message');
$result->setItem(...);
...
return $result->json();

Тут вам нужен MVC читаем: ru.wikipedia.org/wiki/Model-View-Controller
Т.е. вам нужен класс для работы с шаблонами, который позволит переключить шаблон 1 вызовом.
А лучше возьмите уже готовый фреймворк, там уже все это есть

Не знаю на сколько для вас медленно jquery, но можно сделать так:
$('.my_class').removeClass('my_class')

боюсь здесь только callback`и помогут

Есть механизм связки протоколов и клиентов, грубо говоря при ссылке ftp://.. запускается cuteFTP и т.д.
Если мне память не изменяет, можно добавить туда произвольный протокол и привязать к нем свою программу.
Попробуйте покопать в этом направление.

threejs.org/