Пока остановился на варианте заключения договора с поставщиком ПО о намерении лицензироваться, но это далеко не 100% защита от проблем при проверке, есть нюансы, например по чьей просьбе инициирована проверка и еще ряд условий. Но долицензироваться все равно нужно, пусть и не сразу одним махом. Так как и без письма могут по жалобе придти с проверкой. Т.е. нежданно-негаданно.