Дмитрий Кинаш

*.dt - это неполноценный дамп. База созданная с такой выгрузки может отличаться от оригинальной, но если происходит миграция между разнородными СУБД, то это единственный способ.

Если исходная и новая СУБД та же самая (PostgreSQL, Oracle или DB2), то переносить базу нужно средствами самой СУБД - гарантированная правильная миграция.

1С - это в первую очередь гуи. Не хотите сами заниматься, отдайте тем, кто будут работать в 1С - они зайдут в режиме Конфигуратора и сделают загрузку дампа в пустую базу.

Выгрузка и загрузка *.dt с помощью командной строки тоже имеется, но этим обычно занимаются под виндой и не факт, что заработает на линухе, так как там обычно используют СУБД с нормальным бекапированием. Ключ /DumpIB - для выгрузки и ключ /RestoreIB для загрузки дэтэшки.

Технически реализовать не сложно. Пишите скрипт по 1) выгрузке файлов из "доработанной базы" и "связанных баз", 2) далее замене файлов общих для всех баз объектов в каталогах выгрузки из "связанных баз", 3) загружайте файлы назад в связанные базы.

Единственное, что вам нужно взять во внимание (кроме отслеживания логической целостности конфигурации) в этой схеме - нельзя делать загрузку файлов в базу, которая подключена к хранилищу. Если вам так сильно нужно вносить изменения именно в хранилище (внешние системы контроля версия типа GIT по какой-то причине не подходят), то вам нужно использовать промежуточные базы и цепочка в скрипте увеличивается: 0) обновиться с хранилища, 1) тот же, 2) тот же, 3) тот же но в промежуточную базу, 4) выгрузка из промежуточной базы единого файла конфигурации CF, 5) захват конфигурации в хранилище, 6) сравнение/объединение базы подключенной к хранилищу с полученным на предыдущем шаге файлом (не уверен, что это можно сделать скриптом - возможно нужно будет явно пощелкать мышкой).

Если зачистить прямо все-все, то:
1) через конфигуратор сохраните конфигурацию,
2) создайте новую пустую базу,
3) загрузите в новую базы конфигурацию из оригинальной базы
4) сохранитесь и получите абсолютно пустую базу

Если вам нужно выполнить свертку данных, то это делается специальными обработками. На диске и на сайте ИТС есть обработка "Свертка информационной базы", которая подходит для наиболее популярных конфигураций. Если она вам не подходит, то погуглите другие решения по сайтам 1С-ников (типа infostart.ru). Если и там ничего не найдете, то нужно будет заказать у специалистов написание такой обработки под вашу базу.