Виталий Киренков

Практика показывает - не использовать БЭМ. Ибо все их тонкости только его разработчики и знают, да и по слухам сам яндекс уходит на Stylus.

Прочитайте еще раз, но теперь повнимательней, ибо то что вы здесь написали и то что сказано там- две разные вещи. Специально сейчас нашел и прочитал статью.

Делайте либо в процентах, либо в em-ах, но это уже по-сложнее.

Вам изначальные значения нужно сохранять в какие то переменные, либо допустим дублировать в data- аттрибуты.
Допустим
<input value="1" data-value="1">

input_parent.hide(function(){
input_parent.val(input_parent.data("value"));
});

Вопрос первый - зачем изобретать велосипед?
Вопрос второй - зачем абсолютом добавлять? Поместите их в какую нить обёртку, задайте флоат лефт, и двигайте это обёртку.

SVG.

В официальной документации плагина написано, что меню нежелательно использовать внутри секций. Зачем вам навигация внутри?

"мои якорные ссылки не переносят на нужное место," - вот тут как то непонятно... что за якорные ссылки? как они выглядят? как должны? где должны быть?

С опенкар не знаком, но подозреваю раз это отдельный модуль, значит у него есть свой класс, соответственно от него можно просто оттолкнуться ксс-ом
.some-wrap-component a { color: red;}

Без вёрстки сложно, но если на словах, то вам нужно отнять высоту окна $(window).height() и прибавить высоту блока к которому нужно проскролить. Кажется так, но на ночь глядя могу ошибиться.