Когда начал читать, первая мысль была в сторону антивируса, который при запуске процесса его суспендит до выполнения сканирования, а потом забывает рассуспендить, попробуй снести антивирус.

Всем спасибо, уже не актуально:
habrahabr.ru/blogs/cpp/119438/