Текстовый редактор не указан и у них разные возможности.
Поэтому (для меня) проще всего заменить связкой инструментов GNU: find (поиск файлов по маске и запуск процессов по ним) + sed (собственно, заменяет текст файла по регулярке)
Перед выполнением протестировать на единичных файлах и сохранить исходную версию файлов.
find /path/to/project -type f -name "*.php" -exec sed -i 's/регулярка/новыйтекст/g' {} \;
Но если есть редактор кода, который делает то же самое, то с этим тоже нет проблем.
Предвосхищая вопрос про наличие утилит GNU в Windows, даю ссылку:
https://en.wikipedia.org/wiki/GnuWin32 
