Не соглашусь с тем, что вопрос о необходимости уплаты НДС не стоит. Эльба не является истиной в последней инстанции, а "новые документы" не имеют юридической силы в России (они для Украины, в поддержке Upwork это подтверждают). Юридическую силу имеет последняя оферта в которой написано:

Пункт 4. Назначение сайта и сервисов сайта

Если Пользователи приходят к согласию об условиях предоставления Услуг Фрилансера, Договор об оказании услуг заключается непосредственно между такими Пользователями, согласно положениям, изложенным в Разделе 5 (Договорные отношения между Клиентом и Фрилансером), если только вы не состоите на Оплате труда Upwork.

Пункт 6.3. Бесплатное предоставление и поиск работы

Upwork не представляет Клиентов Фрилансерам и не оказывает помощь Фрилансерам в поиске Работы. Upwork только обеспечивает работу Сервисов Сайта для самостоятельного поиска Фрилансерами Работы. Таким образом, Upwork не взимает плату когда Фрилансер находит подходящего Клиента или Работу. Тем не менее, Клиент и Фрилансер обязуются использовать Сайт для осуществления и получения оплаты в связи с их сотрудничеством, если они находят друг друга через Сайт, как описано ниже в Разделе 7 (Строгое Соблюдение) ниже. Кроме того, Upwork не взимает плату или сборы за размещение публичных отзывов, а также полных или объединенных отзывов, включая Оценку работы.

Пункт 8.1. Услуги

Фрилансер обязуется оказывать свои Услуги профессионально и квалифицированно, и своевременно предоставлять Рабочий Продукт. Способ и порядок оказания Услуг Фрилансера определяются и контролируются исключительно Фрилансером, которого нанимает Клиент в качестве независимого подрядчика.

Пункт 10. Отношения с Upwork

Upwork не является участником взаимодействий между Клиентом и Фрилансером, в том числе объявлений, предложений, отборов заключений договоров, и предоставления Услуг Фрилансера. Upwork не представляет Фрилансеров Клиентам и не помогает Фрилансерам найти Работу. Upwork только обеспечивает доступность Сервисов Сайта, для того чтобы Фрилансеры могли выявить и определить подходят ли им Клиенты, также как и Клиенты могли выявить и определить подходят ли им Фрилансеры. Upwork ни в коем случае не проверяет, не направляет, и не контролирует Фрилансеров или работу, которую они выполняют. Upwork не устанавливает часы работы Фрилансеров, рабочие графики, или место выполнения работ, также как и не вовлечено в определение ставок Вознаграждения Фрилансеров, то ли почасовых, толи фиксированных, установленных для Договора на оказание услуг. Upwork не обучает Фрилансера и не предоставляет ему оборудование, работников, или материалы для выполнения определенного Договора на оказание услуг. Upwork не предоставляет места, где Фрилансеры будут выполнять работу. Upwork не предоставляет каких-либо заверений или гарантий относительно качества, безопасности, законности Услуг Фрилансера; правдивости и точности позиций Фрилансеров в списках на Сайте; квалификации, опыта работы, личности Пользователей, способности Фрилансеров оказать Услуги; способности Клиента заплатить за Услуги Фрилансера; или того что Клиент или Фрилансер фактически совершат сделку.

Пункт 11. Третье лицо выгодополучатель

Пользователи назначают Upwork третьим лицом выгодополучателем от Договоров на оказание услуг, для целей реализации обязанностей в отношении Upwork и для предоставления Upwork выгод от Договоров на оказание услуг.

Условия предоставления услуг и регистрация Учетной Записи не будут создавать или рассматриваться как агентские отношения, франшиза, партнерство или совместное предприятие между Пользователем и Upwork

Пункт 13.1. Договоры об оказании услуг

Вы прямо признаете, соглашаетесь и понимаете, что: (а) Сайт является лишь местом, где Пользователи могут выступать в качестве Клиентов и/или Фрилансеров; (б) Upwork не является участником каких-либо Договоров об оказании услуг между Клиентами и Фрилансерами; (в) вы не являетесь сотрудником Upwork, и Upwork никоим образом не руководит, не направляет и не контролирует Фрилансера или Услуги Фрилансера; (г) Upwork не несет никакой ответственности или обязательств в связи с Договорами об оказании услуг и по ним, за любые действия или бездействия, совершенные как вами, так и другими Пользователями;

То есть Upwork не является агентом фрилансера, не предоставляет услуги по реализации, а услуги подпадающие под НДС предоставляет бесплатно. В этом и состоит разница между Upwork и Uber (или AppStore) - последние являются торговыми площадками. Кажется, что проще заплатить небольшую сумму НДС и забыть, но тогда возникает ряд других вопросов (механизм расчета налогооблагаемой базы по УСН, какими документами это подтверждать и т. п.). Как вариант можно заплатить НДС (прикрыть тылы), а потом требовать возврата излишне уплаченного НДС в судебном порядке и получить нормальное юридическое решение по результатам.