Вообще-то векторные смарт-объекты еще как редактируемы. Двойной клик на нем и открывается: а) если был сделан в Фотошопе, то в новой вкладке/окне Фотошопа; б) если в Иллюстраторе, то запускается Иллюстратор, в нем открывается смарт-объект. Можно изменить что угодно и закрыть с сохранением, а в Фотошопе он обновится автоматически.
Если в векторе сделан, то просто пересохраните 2 svg с нужными цветами фонов и все.
Если не установлен Иллюстратор, то надо установить.
Или у вас просто слой называется Vector Smart Object, а сам слой растрирован?