После ввода нужно вызвать соответствующие события, чтобы скрипты на странице смогли понять, что значение изменилось. Попробуйте так:
document.querySelector('input').value = 'значение';
document.querySelector('input').dispatchEvent(new Event('keyup'));
document.querySelector('input').dispatchEvent(new Event('input'));
document.querySelector('input').dispatchEvent(new Event('change'));
Если не поможет, посмотрите в консоли какие обработчики висят на нужном поле и вручную вызывайте их после изменения значения.
