Блин, у вас столько динамического выделения памяти, что аж старшно становиться! Попробуйте хотя бы выделять память большой пачкой. А лучше вообще на старте работы алгоритма выделить всю необходимую память. Один раз.

Middle

Присмотритесь к Amazon EC2. К примеру, их GPU cluster имеет два процессора Intel Xeon X5570 3.00GHz, каждый содержит 8 ядер. Стоимость за час аренды: $2.10 для Linux, $2.60 для Windows.
У них есть CPU cluster. По заверениям, там должно быть в 2 раза больше CPU.

Однозначно Python + PyQt. Хотя бы потому, что:
1) сложно выстрелить себе в ногу
2) очень большое количество дополнительных библиотек для Python

Имел опыт написания морды для небольшой БД на Linux при помощи Python + PyQt. Написал за ночь. На плюсах я бы неделю корячился, чтобы только окошко вывести…

Machinarium