QR-код на чеке дублирует ту же самую информацию, что и человек может прочитать на чеке.
Куда именно приложение ФНС отправляет данные для проверки, вы можете проверить самостоятельно, если установите их программу
https://kkt-online.nalog.ru/ и воспользуетесь любым сниффером.
Также можно проверить чек на
https://kpkcheck.ru/System/ExpressCheck.aspx
https://ofd.ru/checkinfo
https://ofd-ya.ru/check
https://consumer.1-ofd.ru/#/landing
и пр.