А вариант в виде кода не могли бы показать. Как-то не совсем понимаю... "вы вызываете cssnano для не-цсс файлов" Почему? Там же проверка на css, а далее уже cssnano
Как? Файл даже если пустой, 5 раз компилируется, а 6 нет (а файл по прежнему пустой). Это популярная ошибка на Windows. И проблем в Sass файлах никаких нет.