Country.regions будет возвращать все связанные регионы с данной страной. Ему всё равно какой выборкой ты полчил страны.
На мой взгляд необходимо расширить класс дописав метод который возвращает только активные регионы(итемы), что то типа
- (NSSet*) getActiveRegions;
А уже внутри него делать выборку активных регионов для текущей страны