>> в итоге данные в момент работы резерва на него и пишутся
если я правильно понял, после того, как основной сервер поднимется, на резервном у вас остаются уникальные данные, и отсюда возникает потребность в объединении результатов?
Если это так, то у вас проблема не в объединении двух запросов, а в том, что после восстановления основного сервера первым делом необходимо синхронизировать его с резервным, и дальше работать только с основным.