1. Если доработки объёмные, а заказчик считает, что вы ему "должны", то вежливо объясните, что все доработки за доп. плату по прайсу. Если не доходит – ну, что ж, в чёрный список его.
2. Если общение у вас нормальное, заказчик хороший человек, а доработки совсем небольшие, то иногда можно сделать и так: объяснить, что обычно за это берутся деньги, а вы вот ему сделаете бонусом. Тут время и силы как инвестиция на будущее. Это не редко может улучшить к вам отношение и повлечь сарафан.
3. Удалять сайт ни в коем случае не нужно, даже если бы была такая возможность. Т.е., подобная позиция в корне не верна. Это контрпродуктивно, а зачастую и подло. Для чего вредить человеку, даже плохому? Чтобы проучить? Скорее это лишь породит бурю негатива, а человек станет ещё хуже, чем был. Трудно представить, что чувак такой возьмёт и одумается "Ах, мне удалили сайт. И правильно, заслужил, ведь я был таки наглым куском говна..." и отныне станет другим))) Он просто станет ещё хитрее и говнистее после такого. И в будущем будет меньше доверять фрилансерам. И ещё своим друзьям-заказчикам расскажет, и статью напишет, которая завирусится и нашему брату фрилансеру придётся ещё и этот дополнительный негатив обрабатывать и что-то доказывать. И фрилансеры станут злее и...
P.S. Всё это при условии, что всю предыдущую работу вы действительно сделали качественно и в полном объёме.
P.P.S. И пожалуйста, в любом разговоре старайтесь сохранять дружественность. Именно это определяет в нас людей:)