Можно перейти к
документации и найти там
How can I access filtered items in current order?
Плагин не двигает элементы в DOM, порядок меняется через
position: absolute, но порядок знает объект, расположенный в
$grid.data('isotope') через свойство
filteredItems, которое является массивом.
Вобщем, я предлагаю сохранять объект-маппер, в котором будет сопоставление
store[индекс в DOM] - индекс в отсортированном массивеПример реализации.
