avhdx - это контрольная точка. Вы её когда-то создали и теперь все изменения с этой даты записываются в неё. Если файлы физически живы проверьте настройки загрузки, чтобы загрузочным стоял avhdx, а ещё лучше убедитесь что сделали резервную копию всего и вся и сделайте слияние контрольной точки с основным диском.
Контрольные точки нужны для кратковременного тестирования и мешают работает при долгосрочном использовании.
