Неоднократно на одном из компьютеров проявлялась эта проблема, меняли два раза хард в итоге, что временно помогало, но не навсегда, где-то на год. Был обнаружен симптом во время неполадки - долгий отклик диска, аж до 10 секунд, а иногда после ребута диск вообще переставал был виден. Попробовал диск воткнуть в другой sata-порт, и внезапно пока всё работает. Так что в моём случае грешу на порт матери.
