how_many_times_run_func = int(input("Please enter how many timw you wont run formula: "))
Надо только обернуть это в try except чтобы если введут не цифры то отловить исключение.
Там же можно валидировать чтобы например вводили число не выше 1000
если используете питон ниже 3 версии то вместо 
input используйте 
raw_input
На питоне долго не писал, может кто подтправит
class FormulaRunner:
	def ask_user_run_times():
		try:
			how_many_times_run_func = int(input("Please enter how many timw you wont run formula: "))
			return how_many_times_run_func
		except ValueError:
			print("Ooops value must be a number")
			return FormulaRunner.ask_user_run_times()
	def my_super_formula():
		print("toster.ru")
	
if __name__ == "__main__":
	run_times = FormulaRunner.ask_user_run_times()
	for _ in range(run_times):
		FormulaRunner.my_super_formula()