Как правильно использовать doctrine DBAL?

Исчерпывающе. Спасибо

Как правильно использовать doctrine DBAL?

Неправильно скопировал пример.

Из-за чего возникает пустой $_SERVER['REQUEST_URI']?

Про CLI спасибо, забыл про такую возможность.

Как провести удаленную отладку c помощью Xdebug?

После тестирования все изменения переносятся на продкашен

Как провести удаленную отладку c помощью Xdebug?

Репозиторий тестового проекта.