Василий

Хотелось бы научится так, чтобы мог собирать свои дистрибутивы и работать с ним свободно

Вам шашечки или ехать?
Собирать дистрибутивы и работать в них это разные вещи. Нужно перейти, просто переходите.

Тут Вам должно помочь RPC (Java RMI).
Либо копать глубже и городить службу.

Если вопрос по оракловой реализации JVM в SDK, то доставьте openjdk-devel и поставьте любимый Debian, так будет проще.

Хватит засирать парню голову, устанавливай и пользуйся, нет проблем с ОС, работает стабильно. Пользую openSuse KDE 64 больше года, проблем не выявил, ну, за исключением дров на редкую периферию, но это для линуксов общая проблема, не считают нужным производители оборудования дрова под них писать.