Возможно все.
основной домен domain.ru, создал доп. домен newdomain.com
создал пользователя newuser, в выпадающем списке выбрал домен для него newdomain.com т.е. логин стал newuser@newdomain.com
указал путь домашней директории
![483eabb5cf46451e856723497d280d67.png](https://habrastorage.org/files/483/eab/b5c/483eabb5cf46451e856723497d280d67.png)
Все. Может проблема в том, что нет записи CNAME для поддомена ftp.newdomain.com (ftp.somedomain.ru в твоем случае)