1. Есть ли какие-либо зависимости между данными? Если нет, пропускаем п.2
2. Автоматизируйте расчёт зависимых данных и вводите только независимые
3. С импортом из xls/xlsx/csv справится Ваш софт?
4. Эти данные каким образом появляются в тех файлах, из которых Вы их забираете? Если есть возможность, было бы неплохо напрямую из источника их забирать автоматически (парсить / импортировать)
5. А точно ли Вам нужен весь объём этих данных?
6. А отдать на аутсорс за 5 000р/мес?