Думаю, баг. У меня тут тоже есть что-то такое: карма-призрак. Заметил, что 2 пункта кармы то прибавляются, то убавляются через некоторые промежутки времени (может, пара месяцев, или месяц, что-то такое), при этом количество голосов не меняется.
Рейтинг же временная вещь и зависит от активности. То есть плюсики за посты/комментарии/ответы/вопросы они повышают рейтинг, но со временем рейтинг уменьшается, то есть у этих плюсов есть период жизни. А карма постоянна. А вообще rtfm http://habrahabr.ru/info/help/karma/
