Удаляйте дублирующие записи, подобным запросом
DELETE u1 FROM users u1, users u2 WHERE u1.id > u2.id AND u1.name = u2.name;
условие WHERE можно редактировать под свои нужды, если дублируется поле name, то условие должно быть соответствующим u1.name = u2.name
Это вполне изящный и действенный способ.
