Здравствуйте.
Вариантов направления вашего развития очень много.
1. Подключение оплаты на сайт лучше делать отдельно, через сервисы. Выбор очень широк. Так как зависит от того сколько будете платить за пользование.
2. Хороший сайт все равно новичку написать не получится, так много будет в последствие доработок. по различным направлениям. Это бесперспективная работа. Так как тягаться с агрегаторами сервисов интернет магазинов глупо. У них все равно надежней и дешевле.
3. Вы всё равно не сможете реализовать даже половину возможностей подключения различных сервисов, а современный интернет магазин уже не может существовать без них.
4. А на малых магазинах до 100 товаров, много не заработаешь и они в конечном случае все равно уйдут на спец. площадки. Им выгоднее платить сервису 3000 р в мес. и получить почти всё. Чем платить Вам ту же сумму и постоянно получать исправления.