По сути если структура страниц изменена, то можете уже запускать сайт на новом домене, но индексация и прочее начнется с нуля. В любом случае поисковики увидят в сайте "новый проект" но это может повлечь за собой некоторые последствия. Если Вы знали что домен продлевать не будете - нужно было запустить проект на новом домене примерно за квартал до окончания срока регистрации старого, и провести не сложные действия, где основным являются: Установка редиректа 301 с старого домена на новый, настройка файла роботс а точнее редактировать Ссылку на сайт (заменить старый на новый адреса) и указать новый адрес карт сайта, при этом не меняя структуры сайта. Затем добавить новый домен в кабинеты Вебмастер и выбрать в качестве основного зеркала новый домен. После чего все показатели через два-три апа передались бы новому домену, а старый спокойно ушел бы на пенсию. По крайней мере моя практика показала данный способ наиболее эфективным при переезде сайта на новый домен.