Можно использовать систему инициализации Systemd. Напишите unit-файл такого вида:
[Unit]
Description=My Script Service
After=multi-user.target
[Service]
User=user # Имя пользователя, от имени которого будет запускаться команда, указанная в ExecStart
WorkingDirectory=/home/user/program # Директория, в которую будет осуществлён переход перед запуском
ExecStart=/home/user/program/venv/bin/python /home/user/program/webui.py
Restart=always # Всегда перезапускать скрипт при его падениях
[Install]
WantedBy=multi-user.target
и сохраните его в директории
/etc/systemd/system с расширением
.service, например,
/etc/systemd/system/my_program.service.
Здесь не используется скрипт
activate для активации виртуального окружения, но вместо этого указывается полный путь к интерпретатору Python внутри этого виртуального окружения.
Также важно указывать абсолютные пути к файлам и директориям, даже несмотря на то, что задана рабочая директория
WorkingDirectory.
Если ваш скрипт опирается на сетевые соединение, в секции
Unit в качестве
After задайте
network-online.target вместо
multi-user.target:
After=network-online.target 
