При полном копировании работать будет, только потом нужно будет винде починить загрузчик через режим рекавери (с диска с виндой) скорее всего.
Но не рекомендую. Ставьте систему с ноля и перетаскивайте данные. Не морочьтесь.
Для SSD windows отключает кое что при установке.