Уверен, что для автора уже не актуально, но для тех, у кого проблема появилась и в поиске решения перешли сюда - один из вариантов решения:
в моем случае скидка при оплате наличными отображалась рядом с ценой в карточке товара.
Удалял все скидки в разделе Управление маркетингом, убрал вообще все, что связано со скидками в админке и свойствах товара.
Оказалось, что скидка в карточке товара была прописана в шаблоне. Глупо, но я потратил несколько часов, чтобы до этого допереть.
Проверьте у себя: шаблон/components/bitrix/catalog/.default/bitrix/catalog.element/.default/template.php
