Надо не бороться с последствиями, а устранять причину. Хорошая крупная матрица, достаточное расстояние от монитора. Очень важно правильное освещение, монитор не должен быть сильно ярче или темнее окружения. Шрифты покрупнее, интерфейс одной цветовой гаммы (темное/светлое, кому как). По программам: DarkReader - делает все сайты темными, f.lux - убирает синий цвет, неплохо разгружает глаза. А так да, раз в N минут смотреть в даль.