Настройки хранятся в pref.js , создается чистый профиль через firefox -p или ручками profiles.ini / папка профиля и пихается туда файл. В портативном наверное аналогично.
Если хром, будут блокироваться все куки не от основного домена. Например зашел я на vk.com, куки от него пропустит, а от всяких r.mail.ru metric.yandex.ru и тд заблокирует. Как в других браузерах не знаю.