Недостаточно данных. Неизвестно количество пользователей/компьютеров. С точки зрения обеспечения безотказности имеет смысл поднять на второй площадке не RODS, а GC. Тогда при попадании первой половины компании в эпицентр у вас останется рабочей инфраструктура каталога. Плодить домены без веских оснований нецелесообразно.