Компании, крепко привязавшейся (vendor lock-in) к Майкрософту трудно будет решить данную задачу "с наскоку", особенно без какого-либо опыта у пользователей, а то и даже у ИТ отдела. Вам довольно рисково делать шаги без хорошей консультации среди специалистов.
Обратитесь в компании, специализирующейся на оптимизации ИТ инфраструктуры. Она поможет расставить вам приоритеты и предложит подходящее решение.
В моём понимании для вас возможны следующие шаги:
- критично оценить номенклатуру всех имеющихся ИТ решений, необходимых для ведения бизнеса, обосновав целесообразность использования с финансовой и технической стороны
- оценить набор характеристик всего ПО, реально используемого в ИТ
- рассмотреть альтернативные решения согласно заданным характеристикам, будь на основе Linux или Windows
- провести оценку возможности перевода отдельных сервисов на альтернативные решения. Скорее всего, большая часть изменений должна произойти на уровне серверной части.
- рассмотреть какую часть серверов можно "упаковать" на меньшем количестве серверов при помощи решений виртуализации
- для перевода работы на тонкие клиенты нужны хорошая ИТ инфраструктура (сервера и, в частности, сеть с минимальным временем отклика и достаточной шириной канала) и соответствующая поддержка со стороны ИТ отдела
- оценить насколько квалификация ИТ отдела соответствует нуждам и отправить на курсы повышения квалификации, семинары
Без согласования с начальником ИТ отдела не стоит предпринимать никаких шагов. Будет только хуже - можете развалить весь бизнес.
Сам не являюсь экспертом в области оптимизации ИТ и это лишь моё мнение.