Apache virtualhost (dns?) Почему не открывает по имени один из двух сайтов?

за расположении папок сайтов это уже отвечает apache2, его надо настроить в полной мере.
по поводу днс любые домены прописываются с точкой в конце!
site1.ru. и соответственно site2.ru.

Nginx не видит php file?

Alexander: fastcgi_pass unix:/var/run/php7.0-fpm.sock; этот сокет существует?