зачем вам вообще кастомная соль, когда в пыхе уже есть встроенный и вменяемый механизм работы с паролями?
ну а если хотите костылить, то при каждом логине проверяете по старой базе, и если прошло солите и сохраняете в новой. плюс ставите флаг, что этого юзера надо брать с новой базы.