Смотря чем занимаетесь. jinja - шаблонизатор, если вы не используете его в своем проекте, то по и бог с ним.
Допустим для простого API для своих проектов вовсе не нужны html документы, а уж тем более с подстановкой переменных, собственно, jinja тоже не нужен. Или если все же html документы используются, но они статичны, как в сайте-визитке
Если Flask используется для написания полноценного сайта, то без знаний jinja уже не обойтись.