:)) это же смотря для чего… одно - хранить временно некритичные данные, создавая структуру каждый раз при перезагрузке; другое - хранить вечно регулярно пополняющиеся громадные массивы из множества таблиц, с многоэтажными select-ами и прочими join-ами и union-ами (тьфу-тьфу-тьфу).
itsLegend, рекомендую развернуть вопрос, отредактируйте и добавьте туда очевидные для вас, но неизвестные отвечающим сведения: требования к надежности, скорости, способу взаимодействия, типы данных, объёмы; вообще, прям обязательно mysql? Для таких задач есть и относительно простенькие, типа sqlite3, и навороченные и специфичные, типа redis.
