Js файл реализует пагинатор для перелистывания каталога товаров. В переменную которая которая указывает количество страниц для перехода нужно записать значение из другой переменной из php файла. Как?
в пхп прямо в текст сгенеренной страницы вставить тег script с js, который устанавливает глобальную переменную (например window.my_app_page_count), в js скрипте эту переменную использовать по назначению.