<link rel="stylesheet" href="somecss.css" type="text/css">
// удалить все стили
Array.from(document.querySelectorAll('link[rel=stylesheet]')).forEach(css => css.remove())
// перед forEach можете добавить filter если нужно удалить конкретные файлы
// Затем грузите новый css
var element = document.createElement('link')
element.setAttribute('rel', 'stylesheet')
element.setAttribute('href', 'somecss2.css')
document.getElementsByTagName('head')[0].appendChild(element)