По идее, никак. Сначала выстраивается DOM-дерево, применяются стили, и только потом отрабатывает js. Можно просто скрыть блок изначально, а когда код отработал - симпатично анимировать его появление.
PS. $('#checkbox').click() - плохая идея, лучше использовать $('#checkbox').change().
учи мат.часть - js выполняется на стороне клиента, т.ч. все зависит от браузера и железа пользователей. у меня никаких тормозов. $('#checkbox') дожен сохраняться в переменную, а не гонять поиск каждый раз