Обычно Alt-F4 вызывает штатную процедуру завершения приложения (окно при этом то же уничтожается).
Но taskkill - действует не так как ALT-F4 - taskkill ничего приложению не сообщает, она говорит ОС, что надо принудительно закрыть приложение со всеми вытекающими.
Если вас устраивает действие taskkill можете использовать ее, если нет - другие варианты.